MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 8577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	AT	3	6	15	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004603	TA	4	8	27	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004603	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004603	CGA	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004603	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004603	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004603	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004603	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004603	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004603	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004603	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004603	CAAAAA	2	12	2336	2347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004603	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_004603	GTTA	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004603	TGG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004603	C	6	6	4059	4064	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_004603	TTCA	2	8	4065	4072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004603	GATAAA	2	12	4214	4225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004603	AGT	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004603	AAG	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004603	TA	3	6	4825	4830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004603	GAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004603	CAA	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004603	CCGG	2	8	4918	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004603	AGAAA	2	10	6410	6419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004603	TAC	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004603	GTTA	2	8	7289	7296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004603	TAAA	2	8	7304	7311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004603	AG	3	6	7336	7341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004603	TAA	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004603	ATA	2	6	7365	7370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004603	AGG	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004603	GA	3	6	11342	11347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004603	A	6	6	13791	13796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004603	GCT	2	6	13810	13815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004603	T	6	6	13815	13820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004603	TGG	2	6	13827	13832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004603	CAC	2	6	13842	13847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_004603	CTA	2	6	13874	13879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004603	AAG	2	6	14104	14109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004603	CCG	2	6	14686	14691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_004603	TTG	2	6	14710	14715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004603	T	7	7	14767	14773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004603	TGA	2	6	14799	14804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004603	AGA	2	6	14849	14854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004603	CA	3	6	14911	14916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004603	TTAA	2	8	15053	15060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004603	TTA	2	6	16943	16948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004603	GAA	3	9	16972	16980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004603	A	6	6	16979	16984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004603	TCA	2	6	16990	16995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_004603	A	6	6	17021	17026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004603	TGG	2	6	17050	17055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004603	AAC	2	6	19170	19175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004603	CAA	2	6	19219	19224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004603	AAT	2	6	19271	19276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004603	CAA	2	6	19303	19308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004603	A	6	6	19307	19312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004603	CG	3	6	22376	22381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004603	AATAA	2	10	22462	22471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004603	CTG	2	6	22567	22572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004603	CAA	2	6	22621	22626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004603	GGT	2	6	22628	22633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004603	TGA	2	6	22668	22673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004603	GTTC	2	8	22691	22698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004603	ATC	2	6	22774	22779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004603	AAT	2	6	22818	22823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004603	TAAC	2	8	24175	24182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004603	CGTT	2	8	24199	24206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004603	A	6	6	24208	24213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004603	T	7	7	24240	24246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004603	AAC	2	6	24273	24278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004603	TCAA	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_004603	AGC	2	6	26695	26700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004603	CTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004603	TCA	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004603	TAA	2	6	26801	26806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004603	GCC	2	6	26827	26832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_004603	TCG	2	6	30314	30319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004603	TATTCT	2	12	30345	30356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004603	AGTT	2	8	30371	30378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004603	T	6	6	30408	30413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004603	TCAA	2	8	31171	31178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004603	TGC	2	6	33203	33208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004603	A	7	7	33226	33232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004603	A	8	8	33235	33242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004603	GAAA	2	8	33311	33318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004603	GAA	2	6	33363	33368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004603	A	7	7	33374	33380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004603	TG	3	6	33476	33481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004603	TGA	2	6	33491	33496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004603	GGC	2	6	33668	33673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004603	GCG	2	6	33742	33747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004603	ATG	2	6	33819	33824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004603	CGA	2	6	33917	33922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004603	GAT	2	6	33942	33947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004603	GCA	2	6	33991	33996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004603	GT	3	6	34044	34049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004603	GAA	2	6	34050	34055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004603	GTAGT	2	10	34094	34103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004603	ATT	2	6	34114	34119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004603	AGA	2	6	34133	34138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004603	CAG	2	6	34159	34164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004603	GGT	2	6	34224	34229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004603	G	6	6	34306	34311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004603	GGC	2	6	34370	34375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004603	GAA	2	6	34613	34618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004603	TGC	2	6	34689	34694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004603	GTC	2	6	34701	34706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004603	GGA	2	6	34815	34820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004603	GAC	2	6	34828	34833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004603	TCA	2	6	34840	34845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004603	AC	3	6	34866	34871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004603	GGC	2	6	34895	34900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_004603	CGT	2	6	34934	34939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004603	AC	3	6	35035	35040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004603	GTAG	2	8	35076	35083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004603	G	6	6	35094	35099	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004603	CCT	2	6	35176	35181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_004603	GAT	2	6	35187	35192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004603	CA	3	6	35210	35215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004603	TAAAG	2	10	35231	35240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004603	AGA	3	9	35241	35249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004603	CGG	2	6	35311	35316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004603	TTC	2	6	35427	35432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004603	GAA	2	6	35438	35443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004603	CCA	2	6	35527	35532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_004603	GAA	2	6	35634	35639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004603	ACA	2	6	35674	35679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004603	TTG	2	6	35685	35690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004603	CAT	2	6	35783	35788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004603	TCA	2	6	35822	35827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004603	GTA	2	6	35909	35914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004603	GTA	2	6	35937	35942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004603	AGG	2	6	36022	36027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004603	GCG	2	6	36094	36099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004603	CGA	2	6	36158	36163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004603	GAC	2	6	36187	36192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004603	GT	3	6	36193	36198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004603	G	6	6	36246	36251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004603	TCC	2	6	36256	36261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_004603	TAC	2	6	36271	36276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004603	TGAC	2	8	36277	36284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004603	GTAC	2	8	36360	36367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_004603	GGA	2	6	36565	36570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004603	TAC	2	6	36688	36693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_004603	AGTA	2	8	36763	36770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004603	AC	3	6	36782	36787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_004603	CGTC	2	8	36800	36807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_004603	TAC	2	6	36851	36856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_004603	AGC	2	6	36908	36913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_004603	CAT	2	6	36914	36919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_004603	AT	3	6	39997	40002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004603	GAA	2	6	40070	40075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_004603	AAC	2	6	49788	49793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_004603	A	6	6	81424	81429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_004603	TTG	2	6	133298	133303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_004603	CCT	2	6	133865	133870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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427	NC_004603	TGATT	2	10	135962	135971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
428	NC_004603	AAGTG	2	10	139003	139012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_004603	TGT	2	6	139141	139146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_004603	CGA	2	6	155948	155953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_004603	A	7	7	171437	171443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_004603	GTGG	2	8	171460	171467	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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